Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Q3

Foxn4, Forkhead box protein N4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn4Q8K3Q3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms