Protein–RNA interactions for Protein: Q8K348

Acvr1c, Activin receptor type-1C, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1cQ8K348 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acvr1cQ8K348 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acvr1cQ8K348 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Acvr1cQ8K348 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Acvr1cQ8K348 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acvr1cQ8K348 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acvr1cQ8K348 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acvr1cQ8K348 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Acvr1cQ8K348 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Acvr1cQ8K348 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Acvr1cQ8K348 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Acvr1cQ8K348 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Acvr1cQ8K348 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Acvr1cQ8K348 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Acvr1cQ8K348 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Acvr1cQ8K348 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Acvr1cQ8K348 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Acvr1cQ8K348 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Acvr1cQ8K348 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Acvr1cQ8K348 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Acvr1cQ8K348 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Acvr1cQ8K348 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Acvr1cQ8K348 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Acvr1cQ8K348 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Acvr1cQ8K348 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Acvr1cQ8K348 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Acvr1cQ8K348 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Acvr1cQ8K348 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Acvr1cQ8K348 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Acvr1cQ8K348 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Acvr1cQ8K348 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Acvr1cQ8K348 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acvr1cQ8K348 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acvr1cQ8K348 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acvr1cQ8K348 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acvr1cQ8K348 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acvr1cQ8K348 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acvr1cQ8K348 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acvr1cQ8K348 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acvr1cQ8K348 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acvr1cQ8K348 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acvr1cQ8K348 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 270.2 ms