Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms