Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms