Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH72

Trim32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim32Q8CH72 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trim32Q8CH72 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim32Q8CH72 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim32Q8CH72 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms