Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFF0

Parp11, Poly [ADP-ribose] polymerase 11, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp11Q8CFF0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp11Q8CFF0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms