Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Hpf1Q8CFE2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Hpf1Q8CFE2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Hpf1Q8CFE2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Hpf1Q8CFE2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Hpf1Q8CFE2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hpf1Q8CFE2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Hpf1Q8CFE2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Hpf1Q8CFE2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Hpf1Q8CFE2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Hpf1Q8CFE2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms