Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc87Q8CDL9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms