Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG3

Vcpip1, Deubiquitinating protein VCIP135, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcpip1Q8CDG3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vcpip1Q8CDG3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vcpip1Q8CDG3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vcpip1Q8CDG3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vcpip1Q8CDG3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vcpip1Q8CDG3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vcpip1Q8CDG3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vcpip1Q8CDG3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vcpip1Q8CDG3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vcpip1Q8CDG3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vcpip1Q8CDG3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vcpip1Q8CDG3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vcpip1Q8CDG3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vcpip1Q8CDG3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Vcpip1Q8CDG3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vcpip1Q8CDG3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vcpip1Q8CDG3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vcpip1Q8CDG3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Vcpip1Q8CDG3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vcpip1Q8CDG3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vcpip1Q8CDG3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vcpip1Q8CDG3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vcpip1Q8CDG3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vcpip1Q8CDG3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vcpip1Q8CDG3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vcpip1Q8CDG3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vcpip1Q8CDG3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vcpip1Q8CDG3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Vcpip1Q8CDG3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vcpip1Q8CDG3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vcpip1Q8CDG3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vcpip1Q8CDG3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vcpip1Q8CDG3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vcpip1Q8CDG3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vcpip1Q8CDG3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vcpip1Q8CDG3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vcpip1Q8CDG3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vcpip1Q8CDG3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vcpip1Q8CDG3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Vcpip1Q8CDG3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vcpip1Q8CDG3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms