Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ9

Phf20l1, PHD finger protein 20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf20l1Q8CCJ9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phf20l1Q8CCJ9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Phf20l1Q8CCJ9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Phf20l1Q8CCJ9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms