Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms