Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L9

Gpcpd1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpcpd1Q8C0L9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gpcpd1Q8C0L9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gpcpd1Q8C0L9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpcpd1Q8C0L9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpcpd1Q8C0L9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpcpd1Q8C0L9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpcpd1Q8C0L9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpcpd1Q8C0L9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpcpd1Q8C0L9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpcpd1Q8C0L9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpcpd1Q8C0L9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpcpd1Q8C0L9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpcpd1Q8C0L9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpcpd1Q8C0L9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpcpd1Q8C0L9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpcpd1Q8C0L9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpcpd1Q8C0L9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpcpd1Q8C0L9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpcpd1Q8C0L9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpcpd1Q8C0L9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpcpd1Q8C0L9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpcpd1Q8C0L9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpcpd1Q8C0L9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpcpd1Q8C0L9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpcpd1Q8C0L9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpcpd1Q8C0L9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpcpd1Q8C0L9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpcpd1Q8C0L9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpcpd1Q8C0L9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpcpd1Q8C0L9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpcpd1Q8C0L9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpcpd1Q8C0L9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms