Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FarsaQ8C0C7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FarsaQ8C0C7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1094.2 ms