Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

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Length 725 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlrc2Q8BZW8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nhlrc2Q8BZW8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nhlrc2Q8BZW8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nhlrc2Q8BZW8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nhlrc2Q8BZW8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlrc2Q8BZW8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlrc2Q8BZW8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlrc2Q8BZW8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlrc2Q8BZW8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlrc2Q8BZW8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlrc2Q8BZW8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlrc2Q8BZW8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlrc2Q8BZW8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlrc2Q8BZW8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms