Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm4aQ8BW72 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm4aQ8BW72 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms