Protein–RNA interactions for Protein: Q8BS47

9430097D07Rik, RIKEN cDNA 9430097D07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9430097D07RikQ8BS47 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9430097D07RikQ8BS47 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9430097D07RikQ8BS47 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9430097D07RikQ8BS47 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9430097D07RikQ8BS47 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9430097D07RikQ8BS47 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9430097D07RikQ8BS47 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9430097D07RikQ8BS47 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9430097D07RikQ8BS47 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9430097D07RikQ8BS47 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9430097D07RikQ8BS47 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
9430097D07RikQ8BS47 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9430097D07RikQ8BS47 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9430097D07RikQ8BS47 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9430097D07RikQ8BS47 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
9430097D07RikQ8BS47 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
9430097D07RikQ8BS47 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
9430097D07RikQ8BS47 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
9430097D07RikQ8BS47 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
9430097D07RikQ8BS47 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
9430097D07RikQ8BS47 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
9430097D07RikQ8BS47 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
9430097D07RikQ8BS47 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
9430097D07RikQ8BS47 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
9430097D07RikQ8BS47 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
9430097D07RikQ8BS47 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9430097D07RikQ8BS47 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms