Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rufy1Q8BIJ7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rufy1Q8BIJ7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms