Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
D130040H23RikQ8BII3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms