Protein–RNA interactions for Protein: Q8BI72

Cdkn2aip, CDKN2A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2aipQ8BI72 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdkn2aipQ8BI72 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkn2aipQ8BI72 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms