Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smndc1Q8BGT7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Smndc1Q8BGT7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Smndc1Q8BGT7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smndc1Q8BGT7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smndc1Q8BGT7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smndc1Q8BGT7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smndc1Q8BGT7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smndc1Q8BGT7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smndc1Q8BGT7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smndc1Q8BGT7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smndc1Q8BGT7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smndc1Q8BGT7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smndc1Q8BGT7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smndc1Q8BGT7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smndc1Q8BGT7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smndc1Q8BGT7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Smndc1Q8BGT7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smndc1Q8BGT7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smndc1Q8BGT7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smndc1Q8BGT7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Smndc1Q8BGT7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smndc1Q8BGT7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms