Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vipas39Q8BGQ1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Vipas39Q8BGQ1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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Vipas39Q8BGQ1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vipas39Q8BGQ1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vipas39Q8BGQ1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vipas39Q8BGQ1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vipas39Q8BGQ1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vipas39Q8BGQ1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vipas39Q8BGQ1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vipas39Q8BGQ1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vipas39Q8BGQ1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vipas39Q8BGQ1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vipas39Q8BGQ1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vipas39Q8BGQ1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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Vipas39Q8BGQ1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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Vipas39Q8BGQ1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vipas39Q8BGQ1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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Vipas39Q8BGQ1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vipas39Q8BGQ1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vipas39Q8BGQ1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vipas39Q8BGQ1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vipas39Q8BGQ1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vipas39Q8BGQ1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vipas39Q8BGQ1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vipas39Q8BGQ1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vipas39Q8BGQ1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vipas39Q8BGQ1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vipas39Q8BGQ1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vipas39Q8BGQ1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vipas39Q8BGQ1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vipas39Q8BGQ1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vipas39Q8BGQ1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vipas39Q8BGQ1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vipas39Q8BGQ1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vipas39Q8BGQ1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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