Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
U2af1l4Q8BGJ9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms