Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Htatsf1Q8BGC0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms