Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms