Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pknox2Q8BG99 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms