Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Necab1Q8BG18 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms