Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms