Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS9

Stkld1, Serine/threonine kinase-like domain-containing protein STKLD1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stkld1Q80YS9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stkld1Q80YS9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Stkld1Q80YS9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stkld1Q80YS9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stkld1Q80YS9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stkld1Q80YS9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stkld1Q80YS9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stkld1Q80YS9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stkld1Q80YS9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stkld1Q80YS9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stkld1Q80YS9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stkld1Q80YS9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stkld1Q80YS9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stkld1Q80YS9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stkld1Q80YS9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stkld1Q80YS9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stkld1Q80YS9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stkld1Q80YS9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stkld1Q80YS9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stkld1Q80YS9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stkld1Q80YS9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stkld1Q80YS9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stkld1Q80YS9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stkld1Q80YS9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stkld1Q80YS9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms