Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ube3cQ80U95 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms