Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
NischQ80TM9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
NischQ80TM9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
NischQ80TM9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC42.56■■■■■ 4.4
NischQ80TM9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
NischQ80TM9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
NischQ80TM9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
NischQ80TM9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
NischQ80TM9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
NischQ80TM9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC42.55■■■■■ 4.4
NischQ80TM9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
NischQ80TM9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC42.53■■■■■ 4.4
NischQ80TM9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.53■■■■■ 4.4
NischQ80TM9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC42.52■■■■■ 4.4
NischQ80TM9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
NischQ80TM9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC42.52■■■■■ 4.4
NischQ80TM9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
NischQ80TM9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.52■■■■■ 4.4
NischQ80TM9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
NischQ80TM9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
NischQ80TM9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
NischQ80TM9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC42.5■■■■■ 4.39
NischQ80TM9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
NischQ80TM9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
NischQ80TM9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC42.49■■■■■ 4.39
NischQ80TM9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
NischQ80TM9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC42.48■■■■■ 4.39
NischQ80TM9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
NischQ80TM9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
NischQ80TM9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
NischQ80TM9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
NischQ80TM9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
NischQ80TM9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
NischQ80TM9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
NischQ80TM9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
NischQ80TM9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
NischQ80TM9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
NischQ80TM9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC42.45■■■■■ 4.39
NischQ80TM9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
NischQ80TM9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
NischQ80TM9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
NischQ80TM9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
NischQ80TM9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.39
NischQ80TM9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
NischQ80TM9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
NischQ80TM9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
NischQ80TM9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
NischQ80TM9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
NischQ80TM9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
NischQ80TM9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
NischQ80TM9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
NischQ80TM9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
NischQ80TM9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
NischQ80TM9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
NischQ80TM9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
NischQ80TM9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
NischQ80TM9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
NischQ80TM9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
NischQ80TM9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
NischQ80TM9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
NischQ80TM9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
NischQ80TM9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC42.39■■■■■ 4.38
NischQ80TM9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
NischQ80TM9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC42.39■■■■■ 4.38
NischQ80TM9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
NischQ80TM9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
NischQ80TM9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
NischQ80TM9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
NischQ80TM9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
NischQ80TM9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
NischQ80TM9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
NischQ80TM9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.37
NischQ80TM9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
NischQ80TM9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
NischQ80TM9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
NischQ80TM9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
NischQ80TM9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
NischQ80TM9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC42.36■■■■■ 4.37
NischQ80TM9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC42.36■■■■■ 4.37
NischQ80TM9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
NischQ80TM9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
NischQ80TM9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
NischQ80TM9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
NischQ80TM9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
NischQ80TM9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
NischQ80TM9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
NischQ80TM9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
NischQ80TM9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
NischQ80TM9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC42.33■■■■■ 4.37
NischQ80TM9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
NischQ80TM9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
NischQ80TM9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
NischQ80TM9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
NischQ80TM9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
NischQ80TM9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC42.31■■■■■ 4.36
NischQ80TM9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
NischQ80TM9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
NischQ80TM9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
NischQ80TM9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
NischQ80TM9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
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