Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cdc42bpbQ7TT50 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cdc42bpbQ7TT50 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cdc42bpbQ7TT50 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cdc42bpbQ7TT50 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cdc42bpbQ7TT50 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cdc42bpbQ7TT50 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cdc42bpbQ7TT50 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cdc42bpbQ7TT50 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdc42bpbQ7TT50 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdc42bpbQ7TT50 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdc42bpbQ7TT50 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdc42bpbQ7TT50 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cdc42bpbQ7TT50 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cdc42bpbQ7TT50 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cdc42bpbQ7TT50 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cdc42bpbQ7TT50 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Cdc42bpbQ7TT50 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cdc42bpbQ7TT50 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cdc42bpbQ7TT50 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cdc42bpbQ7TT50 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cdc42bpbQ7TT50 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cdc42bpbQ7TT50 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cdc42bpbQ7TT50 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cdc42bpbQ7TT50 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cdc42bpbQ7TT50 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cdc42bpbQ7TT50 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cdc42bpbQ7TT50 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdc42bpbQ7TT50 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdc42bpbQ7TT50 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdc42bpbQ7TT50 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdc42bpbQ7TT50 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdc42bpbQ7TT50 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdc42bpbQ7TT50 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cdc42bpbQ7TT50 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cdc42bpbQ7TT50 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cdc42bpbQ7TT50 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cdc42bpbQ7TT50 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cdc42bpbQ7TT50 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cdc42bpbQ7TT50 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cdc42bpbQ7TT50 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cdc42bpbQ7TT50 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cdc42bpbQ7TT50 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cdc42bpbQ7TT50 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cdc42bpbQ7TT50 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cdc42bpbQ7TT50 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cdc42bpbQ7TT50 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cdc42bpbQ7TT50 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cdc42bpbQ7TT50 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cdc42bpbQ7TT50 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cdc42bpbQ7TT50 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cdc42bpbQ7TT50 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cdc42bpbQ7TT50 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cdc42bpbQ7TT50 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cdc42bpbQ7TT50 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cdc42bpbQ7TT50 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms