Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Clec18aQ7TSQ1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Clec18aQ7TSQ1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Clec18aQ7TSQ1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Clec18aQ7TSQ1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Clec18aQ7TSQ1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Clec18aQ7TSQ1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Clec18aQ7TSQ1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Clec18aQ7TSQ1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Clec18aQ7TSQ1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Clec18aQ7TSQ1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Clec18aQ7TSQ1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Clec18aQ7TSQ1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Clec18aQ7TSQ1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Clec18aQ7TSQ1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Clec18aQ7TSQ1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Clec18aQ7TSQ1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Clec18aQ7TSQ1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Clec18aQ7TSQ1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Clec18aQ7TSQ1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Clec18aQ7TSQ1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Clec18aQ7TSQ1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Clec18aQ7TSQ1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Clec18aQ7TSQ1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Clec18aQ7TSQ1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Clec18aQ7TSQ1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Clec18aQ7TSQ1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Clec18aQ7TSQ1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Clec18aQ7TSQ1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Clec18aQ7TSQ1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Clec18aQ7TSQ1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Clec18aQ7TSQ1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Clec18aQ7TSQ1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Clec18aQ7TSQ1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Clec18aQ7TSQ1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Clec18aQ7TSQ1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Clec18aQ7TSQ1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Clec18aQ7TSQ1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Clec18aQ7TSQ1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Clec18aQ7TSQ1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Clec18aQ7TSQ1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Clec18aQ7TSQ1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Clec18aQ7TSQ1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Clec18aQ7TSQ1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Clec18aQ7TSQ1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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