Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Kcnf1Q7TSH7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Kcnf1Q7TSH7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Kcnf1Q7TSH7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnf1Q7TSH7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnf1Q7TSH7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnf1Q7TSH7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnf1Q7TSH7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnf1Q7TSH7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnf1Q7TSH7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnf1Q7TSH7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnf1Q7TSH7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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