Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Prrc2bQ7TPM1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Prrc2bQ7TPM1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prrc2bQ7TPM1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms