Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMB8

Cyfip1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyfip1Q7TMB8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyfip1Q7TMB8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms