Protein–RNA interactions for Protein: Q7M750

Opalin, Opalin, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OpalinQ7M750 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OpalinQ7M750 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
OpalinQ7M750 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OpalinQ7M750 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OpalinQ7M750 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OpalinQ7M750 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OpalinQ7M750 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OpalinQ7M750 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OpalinQ7M750 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
OpalinQ7M750 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OpalinQ7M750 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OpalinQ7M750 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OpalinQ7M750 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OpalinQ7M750 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OpalinQ7M750 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OpalinQ7M750 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OpalinQ7M750 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OpalinQ7M750 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OpalinQ7M750 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OpalinQ7M750 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OpalinQ7M750 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms