Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms