Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pdcl2Q78Y63 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms