Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms