Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sys1Q78S06 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sys1Q78S06 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sys1Q78S06 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sys1Q78S06 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sys1Q78S06 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sys1Q78S06 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sys1Q78S06 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sys1Q78S06 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sys1Q78S06 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sys1Q78S06 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sys1Q78S06 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sys1Q78S06 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sys1Q78S06 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sys1Q78S06 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sys1Q78S06 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sys1Q78S06 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sys1Q78S06 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sys1Q78S06 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sys1Q78S06 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sys1Q78S06 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sys1Q78S06 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sys1Q78S06 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sys1Q78S06 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sys1Q78S06 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sys1Q78S06 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sys1Q78S06 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sys1Q78S06 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sys1Q78S06 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sys1Q78S06 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sys1Q78S06 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sys1Q78S06 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sys1Q78S06 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sys1Q78S06 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sys1Q78S06 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sys1Q78S06 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sys1Q78S06 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms