Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim12Q78RX3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms