Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms