Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms