Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Mindy1Q76LS9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Mindy1Q76LS9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mindy1Q76LS9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mindy1Q76LS9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Mindy1Q76LS9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Mindy1Q76LS9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mindy1Q76LS9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mindy1Q76LS9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mindy1Q76LS9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Mindy1Q76LS9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mindy1Q76LS9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mindy1Q76LS9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Mindy1Q76LS9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Mindy1Q76LS9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Mindy1Q76LS9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mindy1Q76LS9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mindy1Q76LS9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mindy1Q76LS9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Mindy1Q76LS9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mindy1Q76LS9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mindy1Q76LS9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mindy1Q76LS9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mindy1Q76LS9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mindy1Q76LS9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mindy1Q76LS9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mindy1Q76LS9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mindy1Q76LS9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mindy1Q76LS9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mindy1Q76LS9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mindy1Q76LS9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mindy1Q76LS9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mindy1Q76LS9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mindy1Q76LS9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mindy1Q76LS9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mindy1Q76LS9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mindy1Q76LS9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mindy1Q76LS9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mindy1Q76LS9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms