Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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