Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl35Q6ZWV7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl35Q6ZWV7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl35Q6ZWV7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl35Q6ZWV7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl35Q6ZWV7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl35Q6ZWV7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl35Q6ZWV7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl35Q6ZWV7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl35Q6ZWV7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl35Q6ZWV7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl35Q6ZWV7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rpl35Q6ZWV7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 383.5 ms