Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Topbp1Q6ZQF0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Topbp1Q6ZQF0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Topbp1Q6ZQF0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Topbp1Q6ZQF0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Topbp1Q6ZQF0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Topbp1Q6ZQF0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Topbp1Q6ZQF0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Topbp1Q6ZQF0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Topbp1Q6ZQF0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Topbp1Q6ZQF0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Topbp1Q6ZQF0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Topbp1Q6ZQF0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Topbp1Q6ZQF0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Topbp1Q6ZQF0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Topbp1Q6ZQF0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Topbp1Q6ZQF0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Topbp1Q6ZQF0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Topbp1Q6ZQF0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Topbp1Q6ZQF0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Topbp1Q6ZQF0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Topbp1Q6ZQF0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Topbp1Q6ZQF0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Topbp1Q6ZQF0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Topbp1Q6ZQF0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Topbp1Q6ZQF0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Topbp1Q6ZQF0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Topbp1Q6ZQF0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Topbp1Q6ZQF0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Topbp1Q6ZQF0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Topbp1Q6ZQF0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Topbp1Q6ZQF0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Topbp1Q6ZQF0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Topbp1Q6ZQF0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Topbp1Q6ZQF0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Topbp1Q6ZQF0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Topbp1Q6ZQF0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Topbp1Q6ZQF0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Topbp1Q6ZQF0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Topbp1Q6ZQF0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Topbp1Q6ZQF0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Topbp1Q6ZQF0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Topbp1Q6ZQF0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Topbp1Q6ZQF0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Topbp1Q6ZQF0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Topbp1Q6ZQF0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Topbp1Q6ZQF0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Topbp1Q6ZQF0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Topbp1Q6ZQF0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Topbp1Q6ZQF0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Topbp1Q6ZQF0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Topbp1Q6ZQF0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Topbp1Q6ZQF0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Topbp1Q6ZQF0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Topbp1Q6ZQF0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Topbp1Q6ZQF0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Topbp1Q6ZQF0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Topbp1Q6ZQF0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Topbp1Q6ZQF0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Topbp1Q6ZQF0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms