Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR4

Kcnt1, Potassium channel subfamily T member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnt1Q6ZPR4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcnt1Q6ZPR4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnt1Q6ZPR4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Kcnt1Q6ZPR4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Kcnt1Q6ZPR4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Kcnt1Q6ZPR4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnt1Q6ZPR4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms