Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPJ3

Ube2o, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme UBE2O, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2oQ6ZPJ3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ube2oQ6ZPJ3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ube2oQ6ZPJ3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ube2oQ6ZPJ3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube2oQ6ZPJ3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube2oQ6ZPJ3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube2oQ6ZPJ3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube2oQ6ZPJ3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms