Protein–RNA interactions for Protein: Q6W9L1

H2-M2, Histocompatibility 2, M region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M2Q6W9L1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms