Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja6Q6S5G4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms